El origen de esta ermita tiene que ver con la llegada a Mas de las Matas de la reliquia de la Santa desde Roma, traída por un peregrino natural de la Ginebrosa.

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En 1660, durante una gran tormenta de granizo el entonces vicario saco la reliquia en procesión y las cosechas se salvaron.

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Propuso entonces el párroco edificar una ermita y eligió para este fin un monte en la partida de El Muro, en cuyas laderas los labradores encontraban restos de antiguas edificaciones ibero-romanas y musulmanas.

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En noviembre de 1661, se inauguró la ermita y durante este acto el Padre Faci nos refieren el milagro de la curación de una mujer tullida.

 

10 años más tardes la ermita tuvo que ampliarse y añadir un pequeño albergue para un ermitaño.

Destruida durante las guerras carlistas fue restaurada y luego abierta al culto hasta finales de los años 60 del pasado siglo, cuando se abandono debido al gran deterioro del edificio por las explosiones de una cantera próxima.

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En 1978 fue restaurada  y  posteriormente volvió a sufrir daños estructurales. En 2012 fue de nuevo recuperada.

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Cuenta la tradición que en este lugar estuvo la ciudad de Florencia.

También es una costumbre Masina decir que los niños provienen de Santa Flora, y en particular de un pequeño cuarto situado a la derecha del altar.